Caracterización filogenética del virus del moquillo canino de perros callejeros en el valle de Katmandú

Virology Journal volumen 20, Número de artículo: 117 (2023) Citar este artículo

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El moquillo canino es una enfermedad altamente contagiosa, a menudo fatal, causada por el virus del moquillo canino (CDV) en perros domésticos y carnívoros salvajes. El virus ha causado epidemias masivas en carnívoros salvajes y cautivos de gran valor para la conservación, como tigres, leones y leopardos. Por lo tanto, comprender y manejar los brotes de CDV es particularmente importante en Nepal, que alberga muchas especies de carnívoros salvajes amenazados, incluidos tigres, leopardos, leopardos de las nieves, dholes y lobos, y también contiene una gran población de perros callejeros. Estudios anteriores han sugerido que el CDV puede representar una amenaza para los carnívoros salvajes, pero no ha habido ningún estudio que caracterice las cepas genéticas del virus que circulan en los carnívoros de Nepal. Recolectamos muestras biológicas invasivas y no invasivas de perros callejeros en el valle de Katmandú y caracterizamos genéticamente las cepas de CDV en los perros para que pertenecieran al linaje Asia-5 mediante el uso de análisis filogenéticos. El mismo linaje también contenía cepas de CDV secuenciadas de perros, civetas, panda rojo y leones en la India. Con base en nuestro análisis filogenético, creemos que es probable que el CDV se mantenga durante el ciclo selvático entre los carnívoros simpátricos, lo que permite los derrames y brotes recurrentes. Es crucial prevenir la transmisión del virus de los huéspedes reservorios a otras especies, especialmente a las poblaciones amenazadas de grandes carnívoros en Nepal. Por lo tanto, recomendamos una vigilancia regular de CDV dirigida a carnívoros salvajes además de los perros domésticos.

El moquillo canino es una enfermedad altamente contagiosa, a menudo fatal, causada por el virus del moquillo canino (CDV). El CDV es un virus de ARN con envoltura monocatenario que pertenece al género Morbillivirus de la familia Paramyxoviridae [1]. La enfermedad se transmite por aerosol y causa síntomas respiratorios, gastrointestinales y nerviosos característicos en perros domésticos infectados (Canis lupus familiaris) y carnívoros salvajes [1,2,3]. Si bien a menudo se considera que es una enfermedad de los perros, el VCD se ha informado en casi todos los miembros de la orden Carnivora, así como en algunos primates y ungulados. Es importante destacar que se sabe que el CDV causa epidemias masivas en carnívoros salvajes de alto valor de conservación. Por ejemplo, los brotes de CDV han causado una mortalidad masiva de leones africanos (Panthera leo leo) en el Parque Nacional Serengeti y leones asiáticos (Panthera leo persica) en el Parque Nacional Gir [4,5,6]. Del mismo modo, el CDV se ha aislado de tigres de Amur (Panthera tigris altaica) y leopardos de Amur (Panthera pardus orientalis) fallecidos en el este de Rusia [7, 8]. También se ha descubierto que la enfermedad infecta a tigres y leopardos cautivos en zoológicos de los Estados Unidos, así como a animales de granja como visones, hurones y martas en los Estados Unidos y Europa [9, 10]. En los últimos años, estos brotes han indicado que los linajes emergentes de CDV han ampliado el rango de huéspedes de la enfermedad [11].

Comprender y manejar los brotes de CDV es particularmente importante en Nepal, que alberga muchas especies de carnívoros salvajes amenazados, incluidos tigres, leopardos, leopardos de las nieves (Panthera uncia), dholes (Cuon alpinus) y lobos (Canis lupus chanco), y también tiene un gran población de perros callejeros [12]. Además, un estudio reciente de vigilancia serológica en félidos salvajes en Nepal confirmó la exposición al CDV en tigres y leopardos, donde más de un tercio de los grandes felinos evaluados presentaban síntomas y tres murieron poco después de haber sido muestreados [13]. De manera similar, estudios previos han demostrado que el CDV es frecuente en las poblaciones de perros callejeros en todo Nepal. Dos encuestas independientes sobre poblaciones de perros callejeros alrededor del Parque Nacional de Chitwan y sus zonas de amortiguamiento realizadas durante 2017 y 2019 identificaron una seroprevalencia de anticuerpos CDV del 17 % y el 80 %, respectivamente [14, 15]. En 2018, un estudio similar en Manang identificó anticuerpos contra el CDV en el 70 % de los perros, mientras que el 13 % dio positivo en la prueba de detección mediante RT-PCR [16]. En todas las situaciones, debido a que los perros y los carnívoros salvajes nunca habían sido vacunados contra el CDV, la presencia de anticuerpos contra el CDV indicaba que estos animales habían estado expuestos y/o infectados con el virus. Además, estas incidencias han estado ocurriendo en o cerca de importantes regiones de vida silvestre de Nepal, y la proximidad de perros infectados y poblaciones de carnívoros salvajes crea el potencial para la transmisión de enfermedades.

Aunque estos estudios previos sugieren que tanto los perros como los carnívoros salvajes han estado expuestos a infecciones por CDV, ningún estudio ha secuenciado genéticamente el ARN del virus. Para comprender mejor el origen evolutivo de CDV en Nepal, caracterizamos genéticamente CDV de brotes en perros callejeros en el valle de Katmandú en 2018. También especulamos sobre el posible ciclo selvático en curso de circulación de CDV entre carnívoros, según el análisis filogenético de linajes de CDV en diversos anfitriones mediante el análisis de secuencias disponibles públicamente de anfitriones de CDV domésticos y salvajes en todo el mundo.

Realizamos este estudio para detectar CDV en perros callejeros en el valle de Katmandú (Fig. 1). Elegimos una localidad densamente poblada en el distrito de Bhaktapur que linda con el bosque comunitario de Suryabinayak al sur (Fig. 1). El bosque comunitario de Suryabinayak es un parche de bosque contiguo en las afueras del sur del valle de Katmandú, y se pueden encontrar muchos carnívoros salvajes como leopardos, civetas, martas y pequeños felinos en las colinas boscosas [17].

La localidad en el centro del distrito de Bhaktapur, donde se recolectaron muestras de excrementos de perros para detectar y caracterizar cepas de CDV en perros callejeros del valle de Katmandú.

Nos asociamos con clínicas veterinarias locales en Katmandú y Bhaktapur para recolectar muestras biológicas invasivas de perros callejeros en nuestra área de muestreo a principios de 2018 (Tabla S1). Los veterinarios locales proporcionaron muestras archivadas (hisopos oculares, de saliva, fecales o rectales) que habían sido almacenadas congeladas de perros callejeros sospechosos de tener infecciones por CDV. Los perros demostraron síntomas clínicos de moquillo canino, incluyendo conjuntivitis, almohadilla dura, secreción nasal y ocular, convulsiones o espasmos corporales [p. en 18].

También recolectamos muestras fecales no invasivas de perros callejeros en el centro de Bhaktapur (Fig. 1). Tomamos muestras de las heces de los perros en un área densamente poblada en el centro de Bhaktapur y usamos un esquema de muestreo estratificado para recolectar un número proporcional de muestras de todas las partes de la región. Tomamos muestras de excrementos de perros frescos en las calles y a lo largo de ellas entre las 7 y las 9 a. m. antes de que el municipio limpiara las calles. El recolector de muestras usó guantes y una mascarilla para evitar la contaminación de la muestra y se cambió los guantes entre cada muestreo. Usamos un hisopo de algodón estéril para frotar la capa externa de moco del excremento y lo agitamos en un criovial lleno con 0,5 ml de estabilizador Trizol. Almacenamos las muestras en un congelador a -80oC en el laboratorio Intrepid Nepal hasta su posterior procesamiento.

Agitamos las muestras (hisopos clínicos y fecales) para distribuir homogéneamente las células en la suspensión de Trizol. Realizamos la extracción de ARN utilizando el kit Direct-zol RNA MiniPrep (Zymo Research, EE. UU.). Llevamos a cabo la síntesis de ADNc a partir del eluido de ARN utilizando Invitrogen Superscript III (ThermoFisher, EE. UU.) y lo almacenamos en un congelador de -80 ° C hasta el procesamiento posterior.

Realizamos la detección mediante PCR del gen de la fosfoproteína (P) del CDV utilizando un conjunto de cebadores específicos de Morbillivirus que amplifica la región de ~390 pb del gen [19]. Los amplicones de PCR se visualizaron en geles de agarosa al 1,5 %, y los productos amplificados se purificaron con el kit ExoSAP-IT™ (Thermofisher, EE. UU.), y las reacciones de secuenciación se realizaron en un termociclador MJ Research PTC-225 Peltier con ABI PRISM® BigDye ™ Terminator V3.1 Cycle Sequencing Kits (Applied Biosystems, EE. UU.) siguiendo los protocolos del fabricante. Finalmente, los productos de secuenciación se resolvieron en ABI 310 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, EE. UU.), y las secuencias del gen P se usaron para confirmar la presencia de CDV usando la herramienta blast contra la base de datos Genbank.

Después de confirmar la presencia de CDV en muestras usando el gen P, amplificamos una porción del gen de la hemaglutinina (H) (aproximadamente 852 pb) usando un método de amplicón en mosaico [20] con los cebadores 3 F/3R y 4 F/4R, y secuenciamos para la caracterización de variantes en muestras positivas. El gen H codifica la glicoproteína de superficie viral que media en la unión entre el virus y las células huésped. Este gen tiene una mayor variabilidad genética que otras partes del genoma y, por lo tanto, se utiliza como marcador para la clasificación de linaje de CDV en la mayoría de los estudios [21].

Para caracterizar el linaje de las cepas de CDV de perros callejeros en Katmandú, comparamos las secuencias de muestra recolectadas para nuestro estudio con todos los linajes de CDV conocidos actualmente. Recopilamos un conjunto de datos de 245 secuencias completas del gen H del CDV (en lo sucesivo, "secuencias de referencia") que se originaron en al menos 26 países diferentes en los cinco continentes (excepto Australia y la Antártida) recopiladas entre 1940 y 2018 (Tabla S2). Este conjunto de datos también incluye secuencias de cepas de vacunas y otras secuencias de 17 linajes diferentes geográficamente definidos de CDV de especies hospedadoras pertenecientes a las familias de carnívoros Canidae, Felidae, Mustelidae, Ailuridae, Procyonidae y Ursidae, que están disponibles públicamente en la base de datos NCBI GenBank. Alineamos todas las secuencias de referencia junto con las secuencias CDV del perro de Katmandú usando MUSCLE ver3.8.425 [22], e inspeccionamos visualmente la alineación y luego recortamos y editamos las secuencias donde fuera necesario usando AliView ver1.26 [23]. Para la reconstrucción del árbol filogenético, seleccionamos el modelo de sustitución de nucleótidos que mejor se ajusta (TVM + G) según el criterio de información bayesiano en jModeltest2 ver2.1.8 [24] del conjunto de datos de alineación. Realizamos un análisis filogenético utilizando este modelo y el método de inferencia bayesiano en MrBayes v3.2.7 [25] con 2 000 000 de iteraciones, muestreando cada 2000 iteraciones y descartando el primer 25 % como quemado. Visualizamos y anotamos el árbol filogenético usando FigTree v1.4.4 [26].

Obtuvimos muestras clínicas de ocho perros sintomáticos admitidos en dos clínicas veterinarias en los distritos de Bhaktapur y Katmandú. De los ocho perros, obtuvimos un total de 15 muestras para analizar CDV, incluidas muestras oculares (n = 7), rectales (n = 7) y de saliva (n = 1). Siete de los perros dieron positivo para CDV a través de uno o más de estos tipos de muestras, mientras que un perro individual dio negativo tanto en muestras oculares como rectales. Del total de quince muestras tomadas, cuatro muestras oculares y cuatro rectales dieron positivo. También recolectamos 44 muestras de heces de las calles de Bhaktapur, entre las cuales solo tres muestras (6,8%) dieron positivo para CDV a través de la prueba de PCR del gen P (Fig. 1).

Determinamos secuencias parciales del gen H (~ 800 pb) de cinco muestras de CDV (cuatro clínicas y una fuente de heces) aisladas de cuatro perros y heces de un perro en el valle de Katmandú (Tabla S1). A partir del análisis filogenético, las cepas de CDV de perros en el valle de Katmandú se clasificaron como linaje Asia-5 (Fig. 2). Este linaje también contenía cepas de CDV secuenciadas de perros, civeta de palma (Paradoxurus hermaphroditus), panda rojo (Ailurus fulgens) y leones asiáticos en la India.

Árbol filogenético construido en base a las secuencias del gen de hemaglutinina (H) de 245 CDV de 27 países y 17 linajes, incluidas las cinco muestras recolectadas de perros (Canis lupus familiaris) en Nepal, este clado está resaltado en rojo claro. El análisis filogenético se realizó utilizando el método de inferencia bayesiano en MrBayes con una ejecución de 2 000 000 de iteraciones, submuestreo por 2000 iteraciones y descartando el 25 % de la muestra para quemarla. Las puntas del árbol filogenético están coloreadas según la familia de su especie huésped/origen. Las vacunas CDV comunes se resaltaron en rojo, Canidae, excepto los perros, se resaltaron en verde, los perros en azul, Mustelidae en púrpura, Felidae en naranja y el resto en color negro. Los valores de probabilidad posteriores de los nodos estimados por inferencia bayesiana se indican en el árbol

Encontramos que los linajes de CDV se agruparon principalmente según las regiones geográficas. Cada linaje constaba de cepas aisladas de diversas especies de carnívoros que coexistían en las respectivas regiones geográficas. Las cepas de virus aisladas de carnívoros pertenecientes a Canidae y Mustelidae fueron las más frecuentes en todos los linajes. El linaje Asia-5 donde se agruparon nuestras muestras de perros del valle de Katmandú es un clado hermano del linaje África-2 que consistió en cepas aisladas de carnívoros en el paisaje del Serengeti, incluidos leones africanos, hiena manchada (Crocuta crocuta), perros salvajes africanos (Lycaon pictus) , zorro orejudo (Otocyon megalotis), chacales (Canis aureus) y perros domésticos (Fig. 2).

Nuestro estudio caracterizó genéticamente las cepas de CDV en perros del valle de Katmandú como el linaje Asia-5, que se identificó por primera vez en 2016, descrito por Bhatt et al. (2019) [2] de perros en India. Más tarde, también se descubrió que el mismo linaje era la variante causante de brotes fatales en leones asiáticos en el Parque Nacional Gir, Gujarat, en el oeste de India, durante 2018, que causó la muerte de casi dos docenas de leones [6]. Las mismas cepas también se identificaron en la civeta de palma asiática y el panda rojo en otras partes de la India [6, 27]. El hecho de que las cepas del CDV encontradas en los perros de Katmandú sean las mismas que las encontradas entre los carnívoros de la India sugiere que la variante Asia-5 puede prevalecer entre los huéspedes reservorio en la región del subcontinente indio, específicamente en la India y Nepal. Se han identificado patrones regionales similares en otras cepas de CDV en otras regiones (visualizadas en la Fig. 2). Por ejemplo, la variante Africa-2 se identificó por primera vez como responsable de la muerte de más de 1000 leones africanos en el Parque Nacional Serengeti, Tanzania, en 1985 [4]. La misma cepa se aisló posteriormente de perros salvajes, hiena manchada y zorro orejudo durante la investigación del brote, y se volvió a detectar en perros salvajes africanos y chacales décadas más tarde [28]. De manera similar, la variante de CDV similar al Ártico que se aisló de tigres de Amur y leopardos de Amur fallecidos en Siberia también se encontró entre los mustélidos en toda la región durante un estudio de vigilancia de CDV a largo plazo de carnívoros salvajes en Rusia [29].

Estos estudios sugieren que las cepas de CDV que son similares o están estrechamente relacionadas circulan regionalmente entre los huéspedes carnívoros simpátricos. Esto nos lleva a creer que el CDV en carnívoros salvajes, como leopardos y tigres, afectados por el virus en Nepal [13] también puede pertenecer al linaje Asia-5. Según Bodgener et al. (2023), los niveles más altos de comportamiento de depredación de perros entre los leopardos que entre los tigres pueden haber aumentado el nivel de exposición asociada al CDV en los leopardos [13]. Sin embargo, es posible que los perros no sean los únicos contribuyentes y que solo desempeñen un pequeño papel en una comunidad de reservorios más compleja. En Rusia, se descubrió que los pequeños carnívoros salvajes, como los mustélidos, eran la fuente más probable de infección en los grandes felinos. En Tanzania, también se determinó que los perros no fueron la fuente directa de infección durante el brote en las poblaciones de leones. Actualmente, Nepal atraviesa fases rápidas de desarrollo y, como resultado, la urbanización y la invasión antropogénica de los hábitats de vida silvestre están cerrando las brechas entre los bosques y los espacios urbanos. Se sabe que existe una alta prevalencia de CDV entre perros en importantes áreas de vida silvestre como Manang, Chitwan, y recientemente también entre leopardos y tigres cercanos a espacios humanos. Estos hallazgos justifican futuras investigaciones para ver si hay alguna dinámica de propagación del CDV entre los carnívoros domésticos y salvajes.

Como se observa en nuestro árbol filogenético de CDV (Fig. 2), en la mayoría de los linajes, los perros domésticos son el huésped o reservorio de CDV más común. Esto probablemente se deba en parte al hecho de que el perro es el más fácil de observar/probar. Los estudios han sugerido que el CDV se mantiene principalmente entre un grupo de carnívoros salvajes, posiblemente pequeños gremios de carnívoros como martas, civetas o mangostas que son de naturaleza relativamente resistente [29, 30], que luego se transmite a los perros callejeros a partir de sus interacciones que ocurren cuando los perros callejeros atacan o se aprovechan de las pequeñas especies de carnívoros. Esto también está respaldado por nuestro árbol filogenético, donde el segundo huésped reservorio más común entre todos los linajes fueron los mustélidos. Las especies de la familia Mustelidae en nuestro conjunto de datos filogenéticos consistieron en tejón europeo (Meles meles), hurón (Mustela putorius furo), visón americano (Neovison vison), marta de garganta amarilla (Martes flavigula), marta de haya (Martes foina), pescador ( Martes pennanti), turón europeo (Mustela putorius), sable (Martes zibellina), comadreja siberiana (Mustela sibirica) y tejón asiático (Meles leucurus) (Tabla S2). Estos mustélidos se distribuyen principalmente en Asia, Europa y América del Norte. Un estudio exhaustivo de Gilbert et al. (2020) [29] sugirieron que los mustélidos en la naturaleza siberiana pueden mantener el CDV a nivel local a través de ciclos selváticos en comunidades de carnívoros con múltiples huéspedes.

En países con grandes poblaciones de perros callejeros como Nepal, los perros tienen el potencial de convertirse en vectores de CDV, ya que interactúan con frecuencia (atacan/matan) con pequeños carnívoros como los mustélidos, y luego son presa de grandes depredadores. Estas dinámicas ecológicas aumentan las posibilidades de propagación e infección del CDV desde pequeños carnívoros hasta perros callejeros y grandes especies de carnívoros o viceversa, que ya están amenazados por una variedad de factores antropogénicos [31]. El valle de Katmandú es uno de esos ejemplos en los que la dinámica de derrame de CDV puede estar en curso activamente a medida que la rápida urbanización y la invasión antropogénica de los hábitats de vida silvestre están cerrando las brechas entre los bosques y los espacios urbanos. Un leopardo macho adulto murió de signos clínicos compatibles con la infección por CDV en 2021 en la región occidental de las afueras de Katmandú [13]. Estudios previos que han demostrado la exposición al CDV a perros, leopardos y tigres en diferentes partes de Nepal sugieren que este ciclo ya puede ser un proceso continuo en la mayoría de las regiones del país. Como tal, se requieren más estudios de vigilancia que utilicen secuenciación molecular para confirmar y caracterizar el CDV entre perros y carnívoros salvajes sospechosos de estar enfermos en Nepal. Además de los carnívoros, especies como los ungulados y los monos han sido infectados con CDV en el pasado y también deben ser vigilados [11].

La mayoría de los esfuerzos de vigilancia se han centrado en los perros, pero es esencial que los futuros programas de vigilancia se amplíen a los carnívoros salvajes, incluidos los mustélidos, vivérridos, así como a los grandes felinos y cánidos. Incluso si los perros no tienen un papel directo en el reservorio de CDV, las poblaciones crecientes y sin control de perros callejeros pueden representar una amenaza para la vida silvestre a través de la depredación, la transmisión de enfermedades y otros medios. Por lo tanto, es crucial implementar programas de castración y vacunación para perros para abordar los desafíos que enfrenta la conservación de la vida silvestre.

Todos los datos están incluidos en el manuscrito. Las secuencias de nucleótidos generadas en este estudio se depositan en NCBI Genbank y las accesiones se enumeran en la Tabla complementaria S1.

Zhao J, Shi N, Sun Y, Martella V, Nikolin V, Zhu C, Zhang H, Hu B, Bai X, Yan X. Patogénesis del virus del moquillo canino en perros mapaches, zorros y visones infectados experimentalmente. Res. antivirales. 2015;122:1–11.

Artículo CAS PubMed Google Académico

Bhatt M, Rajak K, Chakravarti S, Yadav A, Kumar A, Gupta V, Chander V, Mathesh K, Chandramohan S, Sharma A. Análisis filogenético del gen de la hemaglutinina que descifra un nuevo linaje genéticamente distinto del virus del moquillo canino que circula entre los perros domésticos en India. Transfronterizo Emerg Dis. 2019;66(3):1252–67.

Artículo CAS PubMed Google Académico

Krakowka S, Axthelm M, Johnson G, Olsen R, Krakowka S, Blakeslee J. Patobiología comparativa de enfermedades virales. En: CRC Press, Boca Ratón; 1985.

Roelke-Parker ME, Munson L, Packer C, Kock R, Cleaveland S, Carpenter M, O'Brien SJ, Pospischil A, Hofmann-Lehmann R, Lutz H. Una epidemia del virus del moquillo canino en los leones del Serengeti (Panthera leo). Naturaleza. 1996;379(6564):441–5.

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Cleaveland S, Appel M, Chalmers W, Chillingworth C, Kaare M, Dye C. Evidencia serológica y demográfica para perros domésticos como fuente de infección por el virus del moquillo canino para la vida silvestre del Serengeti. Microbiol veterinario. 2000;72(3–4):217–27.

Artículo CAS PubMed Google Académico

Mourya DT, Yadav PD, Mohandas S, Kadiwar R, Vala M, Saxena AK, Shete-Aich A, Gupta N, Purushothama P, Sahay RR. Virus del moquillo canino en leones asiáticos del estado de Gujarat, India. Emergente Infect Dis. 2019;25(11):2128.

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Quigley KS, Evermann JF, Leathers CW, Armstrong DL, Goodrich J, Duncan NM, Miquelle DG. Infección por morbillivirus en un tigre siberiano salvaje en el Lejano Oriente ruso. J Wildl Dis. 2010;46(4):1252–6.

Artículo PubMed Google Académico

Sulikhan NS, Gilbert M, Blidchenko EY, Naidenko SV, Ivanchuk GV, Gorpenchenko TY, Alshinetskiy MV, Shevtsova EI, Goodrich JM, Lewis JC. Virus del moquillo canino en un leopardo salvaje del Lejano Oriente (Panthera pardus orientalis). J Wildl Dis. 2018;54(1):170–4.

Artículo PubMed Google Académico

Appel MJ, Yates RA, Foley GL, Bernstein JJ, Santinelli S, Spelman LH, Miller LD, Arp LH, Anderson M, Barr M. Epizootia del moquillo canino en leones, tigres y leopardos en América del Norte. J Vet Diag Invest. 1994;6(3):277–88.

Artículo CAS PubMed Google Académico

Harder TC, Kenter M, Vos H, Siebelink K, Huisman W, Van Amerongen G, Örvell C, Barrett T, Appel M, Osterhaus A. Virus del moquillo canino de grandes felinos enfermos: propiedades biológicas y relaciones filogenéticas. J Gen Virol. 1996;77(3):397–405.

Artículo CAS PubMed Google Académico

Beineke A, Baumgärtner W, Wohlsein P. Transmisión entre especies del virus del moquillo canino: una actualización. Una Salud. 2015;1:49–59.

Artículo PubMed PubMed Central Google Académico

Adhikari RB, Shrestha M, Puri G, Regmi GR, Ghimire TR. Virus del moquillo canino (CDV): una amenaza emergente para la vida silvestre de Nepal. Appl Sci Technol Anales. 2020;1(1):149–54.

Artículo Google Académico

Bodgener J, Sadaula A, Thapa PJ, Shrestha BK, Gairhe KP, Subedi S, Rijal KR, Pandey P, Joshi JD, Kandel P. Virus del moquillo canino en tigres (Panthera tigris) y leopardos (P. pardus) en Nepal. Patógenos. 2023;12(2):203.

Artículo PubMed PubMed Central Google Académico

Sadaula A, Joshi JD, Lamichhane BR, Gairhe KP, Subedi N, Pokheral CP, Thapaliya S, Pandey G, Rijal KR, Pandey P. Seroprevalence of Canine Distemper and Canine Parvovirus Among Domestic Dogs in Buffer Zone of Chitwan National Park, Nepal. 2022.

McDermott I, Gilbert M, Shah MK, Sadaula A, Anderson NE. Seroprevalencia del virus del moquillo canino (CDV) en la población de perros vagabundos (Canis familiaris) que rodea el Parque Nacional de Chitwan, Nepal. Más uno. 2023;18(2):e0281542.

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Ng D, Carver S, Gotame M, Karmasharya D, Karmacharya D, Man Pradhan S, Narsingh Rana A, Johnson CN. Moquillo canino en el área de conservación de Annapurna en Nepal: implicaciones de la crianza de perros y el comportamiento humano para las enfermedades de la vida silvestre. Más uno. 2019;14(12):e0220874.

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Katuwal HB, Basent H, Sharma HP, Koirala S, Khanal B, Neupane KR, Thapa KB, Panta DB, Parajuli K, Lamichhane S. Evaluación de la vida silvestre de las colinas de Chandragiri, Katmandú: potencialidad para el ecoturismo. Eur J Ecol. 2020;6(1):27–50.

Artículo Google Académico

Creevy KE. Descripción general del moquillo canino - Condiciones generalizadas - Manual veterinario Merck. En. Editado por Corp. MSD; 2016.

Barrett T, Visser I, Mamaev L, Goatley L, Van Bressem MF, Osterhaus A. Los morbillivirus de delfines y marsopas son genéticamente distintos del virus del moquillo focino. Virología. 1993;193(2):1010–2.

Artículo CAS PubMed Google Académico

Müller A, Silva E, Santos N, Thompson G. El origen del virus del moquillo canino en perros domésticos en lobos en libertad en Portugal, según lo revelado por la caracterización del gen de la hemaglutinina. J Wildl Dis. 2011;47(3):725–9.

Artículo PubMed Google Académico

Bolt G, Jensen TD, Gottschalck E, Arctander P, Appel MJ, Buckland R, Blixenkrone M. Diversidad genética del gen de la proteína de unión (H) de los aislamientos de campo actuales del virus del moquillo canino. J Gen Virol. 1997;78(2):367–72.

Artículo CAS PubMed Google Académico

Édgar RC. MUSCLE: un método de alineamiento de secuencias múltiples con una complejidad temporal y espacial reducida. BMC Bioinformática. 2004;5(1):1–19.

Artículo Google Académico

Larsson A. AliView: un visor y editor de alineación rápido y liviano para grandes conjuntos de datos. Bioinformática. 2014;30(22):3276–8.

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Darriba D, Taboada GL, Doallo R, Posada D. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing. Nat Methods. 2012;9(8):772–2.

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Ronquist F, Teslenko M, Van Der Mark P, Ayres DL, Darling A, Höhna S, Larget B, Liu L, Suchard MA, Huelsenbeck JP. MrBayes 3.2: inferencia filogenética bayesiana eficiente y elección de modelo en un gran espacio modelo. Syst Biol. 2012;61(3):539–42.

Artículo PubMed PubMed Central Google Académico

Rambaut A. Higuera v1. 4. En.; 2012.

Kodi H, Putty K, Ganji VK, Bhagyalakshmi B, Reddy YN, Satish K, Prakash MG. Caracterización molecular basada en el gen H de aislamientos de campo del virus del moquillo canino de casos de gastroenteritis canina. Indio J Anim Res. 2021;55(5):561–7.

Google Académico

Nikolin VM, Olarte-Castillo XA, Osterrieder N, Hofer H, Dubovi E, Mazzoni CJ, Brunner E, Goller KV, Fyumagwa RD, Moehlman PD. Virus del moquillo canino en el ecosistema del Serengeti: adaptación molecular a diferentes especies de carnívoros. Mol Ecol. 2017;26(7):2111–30.

Artículo CAS PubMed Google Académico

[ PubMed ] Gilbert M, Sulikhan N, Uphyrkina O, Goncharuk M, Kerley L, Castro EH, Reeve R, Seimon T, McAloose D, Seryodkin IV. Moquillo, extinción y vacunación del tigre de Amur. Proc Natl Acad Sci. 2020;117(50):31954–62.

Artículo CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

Kapil S, Yeary TJ. Desbordamiento del moquillo canino en perros domésticos de la vida silvestre urbana. Clínicas Veterinarias: Práctica de Pequeños Animales. 2011;41(6):1069–86.

Académico de Google de PubMed

Adhikari B, Baral K, Bhandari S, Szydlowski M, Kunwar RM, Panthi S, Neupane B, Koirala RK. Zona de riesgo potencial de mortalidad antropogénica de carnívoros en la provincia de Gandaki, Nepal. Eco Evol. 2022;12(1):e8491.

Artículo PubMed PubMed Central Google Académico

Descargar referencias

Agradecemos al Departamento de Servicios Ganaderos, al Departamento de Parques Nacionales y Conservación de la Vida Silvestre y al Municipio de Bhaktapur por permitirnos realizar este estudio. Agradecemos al Dr. Martin Gilbert por guiarnos durante el desarrollo de ensayos de laboratorio de detección y secuenciación de CDV RT-PCR. Expresamos nuestro agradecimiento a todo el personal, pasantes, colaboradores de CMDN, Intrepid Nepal y Vet for Your Pet Animal Hospital que apoyaron durante varias fases del proyecto.

El trabajo de laboratorio fue apoyado por el Centro de Dinámica Molecular de Nepal, y el trabajo de campo fue apoyado por Vet for Your Pet Animal Hospital. La investigación no recibió ningún fondo externo.

Centro de Dinámica Molecular Nepal, Thapathali, Katmandú, Nepal

Prajwol Manandhar, Rajindra Napit, Saman M Pradhan, Pragun G Rajbhandari, Jessie A Moravek y Dibesh Karmacharya

BIOVAC Nepal, Banepa, Kavre, Nepal

Rajindra Napit, Saman M Pradhan y Dibesh Karmacharya

Veterinario para su hospital de animales de compañía, Gapali, Bhaktapur, Nepal

Pranav R Joshi

Centro de investigación y hospital de animales de Katmandú, Thapathali, Katmandú, Nepal

Rima D Shrestha

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PM, RN, JAM y DK diseñaron el estudio. Muestras recolectadas de PM, RN, JAM, PRJ y RDS. RN y SMP realizaron análisis de laboratorio. PM y PGR realizaron análisis bioinformáticos. PM, RN, PGR, JAM y RDS prepararon y revisaron los borradores iniciales. Todos los autores revisaron críticamente y finalizaron el manuscrito.

Correspondencia a Prajwol Manandhar o Dibesh Karmacharya.

Los autores afirman que los estándares éticos de la revista, tal como se indica en la página de directrices para autores, se mantuvieron durante todo el estudio. Se obtuvieron muestras de perros de clínicas veterinarias privadas en los distritos de Katmandú y Bhaktapur de Nepal que habían llevado a los perros para el tratamiento de enfermedades sospechosas, y no se adquirieron perros específicamente para el estudio. El permiso para recolectar muestras de excrementos de perros en Bhaktapur fue otorgado por los departamentos gubernamentales y el municipio correspondientes.

No aplica.

Los autores declaran no tener conflictos de intereses.

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Reimpresiones y permisos

Manandhar, P., Napit, R., Pradhan, SM y col. Caracterización filogenética del virus del moquillo canino de perros callejeros en el valle de Katmandú. Virol J 20, 117 (2023). https://doi.org/10.1186/s12985-023-02071-6

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Recibido: 05 febrero 2023

Aceptado: 14 de mayo de 2023

Publicado: 06 junio 2023

DOI: https://doi.org/10.1186/s12985-023-02071-6

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